Per effettuare la conquista di Rodi il Gran Maestro Folques de Villaret avviò i preparativi per allestire una flotta composta da navi dell'Ordine e della Repubblica di Genova.
Da Brindisi salparono le navi, facendo vela verso Cipro dove si fermano per imbarcare tutto i Cavalieri. All'inizio dell'estate del 1307 una flotta di 25 galere approdò a Rodi ed i Cavalieri cominciano le operazioni militari.
L'isola aveva una sola città all'estremità orientale del territorio, dotata di due buoni porti: il porto settentrionale del Mandraccio per le galee, e quello orientale per il traffico mercantile.
Solo il 15 agosto 1309, dopo una campagna durata due anni, i Cavalieri riuscirono a vincere la resistenza dei Rodioti, i quali accettarono di sottomettersi a patto che la loro libertà fosse rispettata e che fosse loro permesso di praticare la religione ortodossa.
I Cavalieri, con la resa di Rodi, ottennero anche il controllo di diverse isole limitrofe (Kastellórizo, Bodrum) e quello dei porti anatolici di Bodrum e Castelrosso.
Nel 1310 Folques de Villaret vi stabilì il convento dell'Ordine, e vi fece inalberare la bandiera sui tutti i forti dell'isola, trasferendo ufficialmente il proprio quartier generale da Cipro a Rodi dove, per prima cosa, iniziò a costruire un Ospedale.
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